位于洪都拉斯东北部的莫斯基蒂亚地区，占地总面积为500，000公顷，其中生物圈保留地面积有350，000公顷，缓冲地区为150，000公顷。海拔高度介于海平面与1326米之间。 雷奥普拉塔诺河绵延100公里，实际上整个雷奥普拉塔诺流域都涵盖于保护区之内，除此，保护区还包括保拉亚、关普和锡克雷等河流的大部分领土。这些水路与加勒比海一起构成保护区的边界线。地貌上主要分为两个组成部分：山脉地区岩石林立，格外引人注目，这里还有一条500米深的瀑布；海滨地带则比较平坦，抑或由于数目众多的泻湖的存在，而引起地形的跌宕起伏。这些地区向内延伸仅几公里，最多可达40公里。

    气候潮热，年均降水量随着地区的不同而变化，从少于2850毫米到3000-4000毫米之间，变化不等。年均气温为26．6摄氏度。
    保护区是洪都拉斯境内最大的原始热带雨林保护地，地形的悬殊导致了生态系统类型的广泛分布。其中潮湿的热带森林和极度潮湿的亚热带森林成为两个主要生物带，绝大部分的保护地（约85%）隶属于潮湿的热带森林范围之内，仅有10-15%位于亚热带潮湿的森林地带。这里也是中非地区实属罕见的潮湿热带雨林之一，森林中含有丰富多姿的植物和野生动物，包括几种全球性的濒危动物种。据记载，这里有39种哺乳动物，377种鸟类，126种爬行动物和两栖动物。濒危动物包括大型食蚁动物、貘、美洲虎。